Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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