Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp11Q99K46 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp11Q99K46 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp11Q99K46 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp11Q99K46 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp11Q99K46 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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