Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctu1Q99J10 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms