Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdhb12Q91Y07 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms