Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms