Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms