Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms