Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FgbQ8K0E8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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