Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cog3Q8CI04 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog3Q8CI04 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms