Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc43a2Q8CGA3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms