Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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