Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms