Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Nek11Q8C0Q4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Nek11Q8C0Q4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nek11Q8C0Q4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nek11Q8C0Q4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nek11Q8C0Q4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek11Q8C0Q4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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