Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim35Q8C006 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms