Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms