Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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