Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpc2Q8BKV1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpc2Q8BKV1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms