Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nop53Q8BK35 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nop53Q8BK35 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop53Q8BK35 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop53Q8BK35 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop53Q8BK35 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop53Q8BK35 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop53Q8BK35 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop53Q8BK35 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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