Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc172Q810N9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms