Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms