Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cspg5Q71M36 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cspg5Q71M36 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cspg5Q71M36 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cspg5Q71M36 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cspg5Q71M36 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cspg5Q71M36 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cspg5Q71M36 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cspg5Q71M36 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cspg5Q71M36 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cspg5Q71M36 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cspg5Q71M36 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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