Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ddx55Q6ZPL9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx55Q6ZPL9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ddx55Q6ZPL9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx55Q6ZPL9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ddx55Q6ZPL9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx55Q6ZPL9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ddx55Q6ZPL9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ddx55Q6ZPL9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx55Q6ZPL9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ddx55Q6ZPL9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx55Q6ZPL9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx55Q6ZPL9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx55Q6ZPL9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ddx55Q6ZPL9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ddx55Q6ZPL9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ddx55Q6ZPL9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ddx55Q6ZPL9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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