Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snx13Q6PHS6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snx13Q6PHS6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snx13Q6PHS6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx13Q6PHS6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx13Q6PHS6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms