Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmeff1Q6PFE7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmeff1Q6PFE7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms