Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trak1Q6PD31 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trak1Q6PD31 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms