Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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