Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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