Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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