Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg9aQ68FE2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg9aQ68FE2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms