Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5dQ62240 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms