Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sin3bQ62141 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms