Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga6Q61739 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms