Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cln3Q61124 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cln3Q61124 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cln3Q61124 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cln3Q61124 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms