Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
JrkQ60976 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms