Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf3Q60803 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms