Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc27a1Q60714 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms