Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SkilQ60665 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SkilQ60665 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms