Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sin3aQ60520 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms