Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms