Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms