Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM5

Miga1, Mitoguardin 1, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Miga1Q4QQM5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Miga1Q4QQM5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Miga1Q4QQM5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms