Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prr7Q3V0I2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr7Q3V0I2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms