Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cracr2aQ3UP38 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms