Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms