Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms