Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nom1Q3UFM5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms