Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp39Q3TIX9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp39Q3TIX9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms