Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmem248Q3TBN1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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