Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp1aQ2LKU9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1aQ2LKU9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms