Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm1123Q1RME4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms